Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpusd3Q14AI6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rpusd3Q14AI6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rpusd3Q14AI6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rpusd3Q14AI6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rpusd3Q14AI6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rpusd3Q14AI6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rpusd3Q14AI6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rpusd3Q14AI6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rpusd3Q14AI6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rpusd3Q14AI6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rpusd3Q14AI6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rpusd3Q14AI6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rpusd3Q14AI6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rpusd3Q14AI6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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