Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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