Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Vps8Q0P5W1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vps8Q0P5W1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms