Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SctQ08535 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SctQ08535 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SctQ08535 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SctQ08535 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SctQ08535 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SctQ08535 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SctQ08535 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SctQ08535 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SctQ08535 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SctQ08535 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SctQ08535 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SctQ08535 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SctQ08535 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SctQ08535 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SctQ08535 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SctQ08535 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SctQ08535 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SctQ08535 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SctQ08535 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SctQ08535 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SctQ08535 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SctQ08535 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SctQ08535 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SctQ08535 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SctQ08535 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SctQ08535 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SctQ08535 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SctQ08535 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SctQ08535 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SctQ08535 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SctQ08535 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SctQ08535 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SctQ08535 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SctQ08535 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SctQ08535 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SctQ08535 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SctQ08535 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SctQ08535 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SctQ08535 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SctQ08535 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SctQ08535 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SctQ08535 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SctQ08535 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SctQ08535 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SctQ08535 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SctQ08535 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SctQ08535 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SctQ08535 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SctQ08535 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SctQ08535 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SctQ08535 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SctQ08535 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SctQ08535 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SctQ08535 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SctQ08535 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SctQ08535 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SctQ08535 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SctQ08535 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SctQ08535 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SctQ08535 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SctQ08535 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SctQ08535 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SctQ08535 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SctQ08535 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SctQ08535 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SctQ08535 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SctQ08535 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SctQ08535 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SctQ08535 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SctQ08535 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SctQ08535 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SctQ08535 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SctQ08535 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SctQ08535 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SctQ08535 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SctQ08535 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SctQ08535 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SctQ08535 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SctQ08535 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SctQ08535 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SctQ08535 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SctQ08535 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SctQ08535 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SctQ08535 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SctQ08535 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SctQ08535 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SctQ08535 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SctQ08535 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SctQ08535 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SctQ08535 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SctQ08535 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SctQ08535 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SctQ08535 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SctQ08535 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SctQ08535 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SctQ08535 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SctQ08535 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SctQ08535 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SctQ08535 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms