Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gata4Q08369 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gata4Q08369 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms