Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MestQ07646 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MestQ07646 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MestQ07646 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MestQ07646 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MestQ07646 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MestQ07646 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MestQ07646 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MestQ07646 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MestQ07646 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MestQ07646 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MestQ07646 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MestQ07646 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MestQ07646 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MestQ07646 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MestQ07646 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MestQ07646 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MestQ07646 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MestQ07646 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MestQ07646 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MestQ07646 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MestQ07646 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MestQ07646 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MestQ07646 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MestQ07646 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MestQ07646 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MestQ07646 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MestQ07646 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MestQ07646 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MestQ07646 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MestQ07646 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MestQ07646 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MestQ07646 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MestQ07646 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MestQ07646 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MestQ07646 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MestQ07646 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MestQ07646 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MestQ07646 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MestQ07646 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MestQ07646 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MestQ07646 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MestQ07646 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MestQ07646 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MestQ07646 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MestQ07646 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MestQ07646 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MestQ07646 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MestQ07646 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MestQ07646 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MestQ07646 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MestQ07646 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MestQ07646 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MestQ07646 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MestQ07646 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MestQ07646 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MestQ07646 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MestQ07646 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MestQ07646 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MestQ07646 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MestQ07646 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MestQ07646 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MestQ07646 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MestQ07646 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MestQ07646 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MestQ07646 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MestQ07646 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MestQ07646 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MestQ07646 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MestQ07646 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MestQ07646 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MestQ07646 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MestQ07646 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MestQ07646 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MestQ07646 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MestQ07646 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MestQ07646 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MestQ07646 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MestQ07646 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MestQ07646 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MestQ07646 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MestQ07646 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MestQ07646 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MestQ07646 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MestQ07646 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms