Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col17a1Q07563 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Col17a1Q07563 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Col17a1Q07563 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms