Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cntn3Q07409 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cntn3Q07409 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms