Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CluQ06890 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CluQ06890 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CluQ06890 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CluQ06890 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CluQ06890 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CluQ06890 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CluQ06890 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CluQ06890 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CluQ06890 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CluQ06890 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CluQ06890 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CluQ06890 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CluQ06890 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CluQ06890 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CluQ06890 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CluQ06890 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CluQ06890 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CluQ06890 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CluQ06890 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CluQ06890 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CluQ06890 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CluQ06890 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CluQ06890 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CluQ06890 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CluQ06890 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CluQ06890 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CluQ06890 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CluQ06890 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CluQ06890 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CluQ06890 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CluQ06890 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CluQ06890 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CluQ06890 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CluQ06890 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CluQ06890 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CluQ06890 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CluQ06890 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CluQ06890 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CluQ06890 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CluQ06890 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CluQ06890 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CluQ06890 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CluQ06890 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CluQ06890 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CluQ06890 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CluQ06890 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CluQ06890 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CluQ06890 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CluQ06890 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CluQ06890 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CluQ06890 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CluQ06890 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CluQ06890 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CluQ06890 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CluQ06890 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CluQ06890 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CluQ06890 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CluQ06890 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CluQ06890 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CluQ06890 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CluQ06890 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CluQ06890 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CluQ06890 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CluQ06890 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CluQ06890 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CluQ06890 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CluQ06890 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CluQ06890 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CluQ06890 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CluQ06890 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CluQ06890 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CluQ06890 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CluQ06890 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CluQ06890 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CluQ06890 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CluQ06890 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CluQ06890 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CluQ06890 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CluQ06890 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CluQ06890 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CluQ06890 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CluQ06890 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CluQ06890 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CluQ06890 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CluQ06890 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CluQ06890 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CluQ06890 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CluQ06890 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CluQ06890 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CluQ06890 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CluQ06890 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CluQ06890 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CluQ06890 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CluQ06890 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CluQ06890 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CluQ06890 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CluQ06890 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CluQ06890 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CluQ06890 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms