Protein–RNA interactions for Protein: Q06219

Nr4a2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a2Q06219 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr4a2Q06219 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr4a2Q06219 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms