Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Caprin2Q05A80 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Caprin2Q05A80 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms