Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SryQ05738 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SryQ05738 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SryQ05738 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SryQ05738 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SryQ05738 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SryQ05738 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SryQ05738 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SryQ05738 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SryQ05738 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SryQ05738 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SryQ05738 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SryQ05738 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SryQ05738 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SryQ05738 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SryQ05738 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SryQ05738 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SryQ05738 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SryQ05738 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SryQ05738 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SryQ05738 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SryQ05738 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SryQ05738 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SryQ05738 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SryQ05738 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SryQ05738 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SryQ05738 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SryQ05738 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SryQ05738 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SryQ05738 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SryQ05738 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SryQ05738 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SryQ05738 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SryQ05738 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SryQ05738 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SryQ05738 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SryQ05738 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SryQ05738 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SryQ05738 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SryQ05738 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SryQ05738 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SryQ05738 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SryQ05738 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SryQ05738 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SryQ05738 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SryQ05738 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SryQ05738 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SryQ05738 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SryQ05738 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SryQ05738 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SryQ05738 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SryQ05738 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SryQ05738 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SryQ05738 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SryQ05738 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SryQ05738 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SryQ05738 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SryQ05738 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SryQ05738 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SryQ05738 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SryQ05738 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SryQ05738 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SryQ05738 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SryQ05738 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SryQ05738 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SryQ05738 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SryQ05738 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SryQ05738 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SryQ05738 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SryQ05738 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SryQ05738 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SryQ05738 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SryQ05738 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SryQ05738 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 899.6 ms