Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk18Q04899 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms