Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ddr1Q03146 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms