Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gjb4Q02738 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb4Q02738 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gjb4Q02738 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms