Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd1Q01822 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd1Q01822 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms