Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mc1rQ01727 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mc1rQ01727 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms