Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp1Q01514 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp1Q01514 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms