Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Col1a2Q01149 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Col1a2Q01149 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms