Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shc1P98083 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms