Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Scn1bP97952 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms