Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gfra1P97785 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra1P97785 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms