Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mesp1P97309 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mesp1P97309 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mesp1P97309 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mesp1P97309 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mesp1P97309 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mesp1P97309 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Mesp1P97309 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Mesp1P97309 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Mesp1P97309 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Mesp1P97309 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Mesp1P97309 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Mesp1P97309 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Mesp1P97309 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Mesp1P97309 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp1P97309 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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