Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H3f3aP84244 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3f3aP84244 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3f3aP84244 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms