Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx2P81066 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx2P81066 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx2P81066 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx2P81066 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx2P81066 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx2P81066 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx2P81066 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx2P81066 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx2P81066 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Irx2P81066 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Irx2P81066 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms