Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx2P80206 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx2P80206 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx2P80206 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx2P80206 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx2P80206 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx2P80206 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx2P80206 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otx2P80206 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms