Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ufd1P70362 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms