Protein–RNA interactions for Protein: P70348

Gcm1, Chorion-specific transcription factor GCMa, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm1P70348 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gcm1P70348 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms