Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad54lP70270 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad54lP70270 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad54lP70270 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad54lP70270 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad54lP70270 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad54lP70270 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rad54lP70270 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rad54lP70270 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rad54lP70270 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rad54lP70270 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rad54lP70270 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rad54lP70270 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rad54lP70270 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rad54lP70270 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rad54lP70270 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rad54lP70270 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rad54lP70270 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rad54lP70270 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rad54lP70270 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rad54lP70270 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rad54lP70270 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rad54lP70270 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rad54lP70270 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rad54lP70270 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms