Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd13P70217 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd13P70217 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms