Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps28P62858 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps28P62858 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps28P62858 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps28P62858 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps28P62858 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms