Protein–RNA interactions for Protein: P62852

Rps25, 40S ribosomal protein S25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps25P62852 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps25P62852 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps25P62852 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps25P62852 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps25P62852 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps25P62852 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms