Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps29P62274 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps29P62274 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps29P62274 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps29P62274 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps29P62274 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps29P62274 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps29P62274 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps29P62274 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rps29P62274 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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