Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vbp1P61759 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vbp1P61759 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms