Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem258P61166 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms