Protein–RNA interactions for Protein: P60603

Romo1, Reactive oxygen species modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Romo1P60603 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Romo1P60603 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Romo1P60603 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Romo1P60603 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Romo1P60603 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Romo1P60603 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Romo1P60603 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms