Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppfia3P60469 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfia3P60469 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms