Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm2P58774 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms