Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctbp2P56546 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctbp2P56546 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms