Protein–RNA interactions for Protein: P56475

Gabrr1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr1P56475 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrr1P56475 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrr1P56475 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrr1P56475 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrr1P56475 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrr1P56475 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrr1P56475 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrr1P56475 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrr1P56475 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrr1P56475 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms