Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Sh3bp1P55194 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp1P55194 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms