Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GemP55041 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GemP55041 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GemP55041 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GemP55041 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GemP55041 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GemP55041 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GemP55041 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GemP55041 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GemP55041 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GemP55041 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GemP55041 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GemP55041 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GemP55041 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GemP55041 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GemP55041 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GemP55041 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GemP55041 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GemP55041 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GemP55041 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GemP55041 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GemP55041 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GemP55041 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GemP55041 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GemP55041 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GemP55041 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GemP55041 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GemP55041 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GemP55041 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GemP55041 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GemP55041 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GemP55041 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GemP55041 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GemP55041 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GemP55041 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GemP55041 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GemP55041 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GemP55041 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GemP55041 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GemP55041 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GemP55041 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GemP55041 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GemP55041 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GemP55041 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GemP55041 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GemP55041 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GemP55041 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GemP55041 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GemP55041 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GemP55041 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GemP55041 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GemP55041 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GemP55041 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GemP55041 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GemP55041 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GemP55041 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GemP55041 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GemP55041 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GemP55041 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GemP55041 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GemP55041 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GemP55041 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GemP55041 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GemP55041 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GemP55041 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GemP55041 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GemP55041 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GemP55041 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GemP55041 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GemP55041 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GemP55041 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GemP55041 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GemP55041 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GemP55041 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GemP55041 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GemP55041 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GemP55041 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GemP55041 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GemP55041 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GemP55041 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GemP55041 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GemP55041 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GemP55041 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GemP55041 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GemP55041 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GemP55041 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GemP55041 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GemP55041 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GemP55041 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GemP55041 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GemP55041 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GemP55041 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GemP55041 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GemP55041 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GemP55041 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GemP55041 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GemP55041 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GemP55041 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GemP55041 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GemP55041 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms