Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Fgd1P52734 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fgd1P52734 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms