Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TspoP50637 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TspoP50637 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TspoP50637 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TspoP50637 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TspoP50637 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TspoP50637 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TspoP50637 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TspoP50637 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TspoP50637 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TspoP50637 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TspoP50637 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TspoP50637 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TspoP50637 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TspoP50637 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TspoP50637 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TspoP50637 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TspoP50637 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TspoP50637 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TspoP50637 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TspoP50637 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TspoP50637 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TspoP50637 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TspoP50637 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TspoP50637 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TspoP50637 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TspoP50637 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TspoP50637 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TspoP50637 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TspoP50637 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TspoP50637 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TspoP50637 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TspoP50637 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TspoP50637 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TspoP50637 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TspoP50637 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TspoP50637 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TspoP50637 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TspoP50637 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TspoP50637 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TspoP50637 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TspoP50637 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TspoP50637 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TspoP50637 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TspoP50637 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TspoP50637 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TspoP50637 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TspoP50637 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TspoP50637 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TspoP50637 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TspoP50637 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TspoP50637 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TspoP50637 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TspoP50637 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TspoP50637 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TspoP50637 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TspoP50637 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TspoP50637 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TspoP50637 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TspoP50637 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TspoP50637 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TspoP50637 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TspoP50637 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TspoP50637 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TspoP50637 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TspoP50637 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TspoP50637 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TspoP50637 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TspoP50637 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TspoP50637 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TspoP50637 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TspoP50637 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TspoP50637 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TspoP50637 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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