Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hcls1P49710 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms