Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CitP49025 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CitP49025 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CitP49025 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CitP49025 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CitP49025 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CitP49025 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CitP49025 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CitP49025 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CitP49025 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CitP49025 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CitP49025 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CitP49025 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CitP49025 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CitP49025 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CitP49025 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CitP49025 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CitP49025 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CitP49025 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CitP49025 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CitP49025 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CitP49025 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CitP49025 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CitP49025 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CitP49025 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CitP49025 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CitP49025 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CitP49025 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CitP49025 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CitP49025 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CitP49025 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CitP49025 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CitP49025 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CitP49025 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CitP49025 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CitP49025 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CitP49025 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CitP49025 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CitP49025 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CitP49025 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CitP49025 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CitP49025 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CitP49025 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CitP49025 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CitP49025 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CitP49025 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CitP49025 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CitP49025 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CitP49025 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CitP49025 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CitP49025 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CitP49025 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CitP49025 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CitP49025 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CitP49025 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CitP49025 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CitP49025 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CitP49025 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CitP49025 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CitP49025 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CitP49025 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CitP49025 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CitP49025 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CitP49025 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CitP49025 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CitP49025 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CitP49025 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CitP49025 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CitP49025 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CitP49025 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CitP49025 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CitP49025 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CitP49025 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CitP49025 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CitP49025 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CitP49025 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CitP49025 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CitP49025 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CitP49025 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CitP49025 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CitP49025 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CitP49025 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CitP49025 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CitP49025 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CitP49025 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CitP49025 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CitP49025 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CitP49025 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CitP49025 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CitP49025 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CitP49025 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CitP49025 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CitP49025 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CitP49025 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CitP49025 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CitP49025 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CitP49025 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CitP49025 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CitP49025 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CitP49025 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms