Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbx2P48031 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms