Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrprbP47758 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrprbP47758 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrprbP47758 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SrprbP47758 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SrprbP47758 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SrprbP47758 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SrprbP47758 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SrprbP47758 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SrprbP47758 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SrprbP47758 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SrprbP47758 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrprbP47758 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrprbP47758 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SrprbP47758 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrprbP47758 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrprbP47758 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrprbP47758 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrprbP47758 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrprbP47758 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SrprbP47758 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrprbP47758 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
SrprbP47758 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SrprbP47758 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms