Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox7P40646 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox7P40646 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox7P40646 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox7P40646 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox7P40646 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox7P40646 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox7P40646 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox7P40646 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox7P40646 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox7P40646 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox7P40646 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox7P40646 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox7P40646 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox7P40646 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox7P40646 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox7P40646 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox7P40646 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox7P40646 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox7P40646 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox7P40646 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms