Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lig1P37913 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lig1P37913 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lig1P37913 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lig1P37913 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Lig1P37913 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lig1P37913 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lig1P37913 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lig1P37913 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lig1P37913 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lig1P37913 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lig1P37913 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lig1P37913 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms